乌鲁木齐市妇幼保健院始建于1951年，2013年挂牌成立新疆维吾尔自治区妇幼保健院，是集预防、保健、医疗、科研、教学、培训为一体的三级甲等妇幼保健机构，为妇女儿童提供妇幼健康服务，承担自治区、乌鲁木齐市妇幼健康业务管理和技术支持工作，为国家级妇产科住院医师规范化培训基地，为国家妇幼保健中心、北京协和医院、北京大学各附属医院、东南大学附属中大医院对口援疆单位。
妇幼保健院目前拥有两处院址，位于乌鲁木齐解放南路344号的妇幼保健院，毗邻二道桥商圈，占地7亩，使用面积4.5万平方米，开放床位400张；会展院区位于乌鲁木齐会展大道3838号，毗邻乌鲁木齐奥林匹克体育中心，占地约78亩，建筑面积62000平方米，是集医疗、保健、教学、科研、预防、康复为一体的公立非营利性三级综合医院，编制床位450张。